Utilize the web fullyThanks to cookies, browsing the web will be easier and more comfortable. To process some of them, we need your consent which you can give by clicking the “Accept all” button. More information about cookies and their settings. By refusing, only essential cookies will be loaded.
Accept all Refuse
Show cookie utilization selection

UO > About > Organizational Structure > Faculties & Institutes > Faculty of Science > About > Organizational Structure > Departments & Centres > Department of Biology and Ecology

Petr Pečinka


Academic degree, name, surname:
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Room, floor, building:
M 204, Building M
Position:
Research interests and teaching:
Department (Faculty):
Department of Biology and Ecology (Faculty of Science)
Environmental Center (Faculty of Science)
Phone number, mobile:
+420 553 46 2318
E-mail:



No record found.



Analysis of G-Quadruplex-Forming Sequences in Drought Stress-Responsive Genes, and Synthesis Genes of Phenolic Compounds in Arabidopsis thaliana
Petr Pečinka, Natália Bohálová, Adriana Volná, Kristýna Kundrátová, Václav Brázda, Martin Bartas ... other authors
Year: 2023, Life
journal article
 
Are There Hidden Genes in DNA/RNA Vaccines?
Christopher A. Beaudoin, Martin Bartas, Adriana Volná, Petr Pečinka, Tom L. Blundell
Year: 2022, Frontiers in Immunology
journal article
 
Regulation of Phenolic Compound Production by Light Varying in Spectral Quality and Total Irradiance
Radomír Pech, Adriana Volná, Lena Hunt, Martin Bartas, Jiří Červeň, Petr Pečinka, Vladimír Špunda, Jakub Nezval ... other authors
Year: 2022, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
Searching for New Z-DNA/Z-RNA Binding Proteins Based on Structural Similarity to Experimentally Validated Zα Domain
Martin Bartas, Kristyna Slychko, Jiří Červeň, Christopher A. Beaudoin, Tom L. Blundell, Petr Pečinka, Václav Brázda ... other authors
Year: 2022, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
Unheeded SARS-CoV-2 proteins? A deep look into negative-sense RNA
Martin Bartas, Adriana Volná, Christopher A. Beaudoin, Ebbe Toftgaard Poulsen, Jiří Červeň, Václav Brázda, Vladimír Špunda, Tom L. Blundell, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2022, Briefings in Bioinformatics
journal article
 
What Do We Know about Barley miRNAs?
Adriana Volná, Martin Bartas, Petr Pečinka, Vladimír Špunda, Jiří Červeň
Year: 2022, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
Amino Acid Composition in Various Types of Nucleic Acid-Binding Proteins
Martin Bartas, Jiří Červeň, Simona Guziurová, Kristyna Slychko, Petr Pečinka
Year: 2021, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
Analyses of viral genomes for G-quadruplex forming sequences reveal their correlation with the type of infection
Natália Bohálová, Alessio Cantara, Martin Bartas, Patrik Kaura, Jiří Šťastný, Petr Pečinka, Miroslav Fojta, Jean-Louis Mergny, Václav Brázda ... other authors
Year: 2021, BIOCHIMIE
journal article
 
G-Quadruplex in Gene Encoding Large Subunit of Plant RNA Polymerase II: A Billion-Year-Old Story
Adriana Volná, Martin Bartas, Václav Karlický, Jakub Nezval, Kristýna Kundrátová, Petr Pečinka, Vladimír Špunda, Jiří Červeň ... other authors
Year: 2021, INT J MOL SCI
journal article
 
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains
Martin Bartas, Jiří Červeň, Adriana Volná, Miroslav Fojta, Václav Brázda, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2021, BRIEF BIOINFORM
journal article
 
SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly enriched within inverted repeats and CpG island loci
Pratik Goswami, Martin Bartas, Matej Lexa, Natalia Bohalova, Adriana Volná, Jiří Červeň, Veronika Červeňová, Petr Pečinka, Vladimír Špunda, Miroslav Fojta, Václav Brázda ... other authors
Year: 2021, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
journal article
 
Searching for G-Quadruplex-Binding Proteins in Plants: New Insight into Possible G-Quadruplex Regulation
Adriana Volná, Martin Bartas, Jakub Nezval, Vladimír Špunda, Petr Pečinka, Jiří Červeň ... other authors
Year: 2021, BioTech
journal article
 
The Changes in the p53 Protein across the Animal Kingdom Point to Its Involvement in Longevity
Martin Bartas, Václav Brázda, Adriana Volná, Jiří Červeň, Petr Pečinka, Joanna Zawacka-Pankau ... other authors
Year: 2021, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
journal article
 
Tracing dsDNA Virus-Host Coevolution through Correlation of Their G-Quadruplex-Forming Sequences
Natália Bohálová, Alessio Cantara, Martin Bartas, Patrik Kaura, Jiří Šťastný, Petr Pečinka, Miroslav Fojta, Václav Brázda ... other authors
Year: 2021, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
Transcriptomic and Proteomic Analysis of Drought Stress Response in Opium Poppy Plants during the First Week of Germination
Kristýna Kundrátová, Martin Bartas, Petr Pečinka, Ondřej Hejna, Andrea Rychlá, Vladislav Čurn, Jiří Červeň ... other authors
Year: 2021, Plants-Basel
journal article
 
G-Quadruplexes in the Archaea Domain
Václav Brázda, Yu Luo, Martin Bartas, Patrik Kaura, Otilia Porubiaková, Jiří Šťastný, Petr Pečinka, Daniela Verga, Violette Da Cunha, Tomio S. Takahashi, Patrick Forterre, Hannu Myllykallio, Miroslav Fojta, Jean Louis Mergny ... other authors
Year: 2020, Biomolecules
journal article
 
Characterization of p53 Family Homologs in Evolutionary Remote Branches of Holozoa
Martin Bartas, Václav Brázda, Jiří Červeň, Petr Pečinka
Year: 2020, International Journal of Molecular Sciences
journal article
 
In-Depth Bioinformatic Analyses of Nidovirales Including Human SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV Viruses Suggest Important Roles of Non-canonical Nucleic Acid Structures in Their Lifecycles
Martin Bartas, Václav Brázda, Natália Bohálová, Alessio Cantara, Adriana Volná, Tereza STACHUROVÁ, Kateřina Malachová, Eva Jagelská, Otília Porubiaková, Jiří Červeň, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2020, Frontiers in Microbiology
journal article
 
Identification of Distinct Amino Acid Composition of Human Cruciform Binding Proteins
Jiří Červeň, Petr Pečinka, Martin Bartas, Václav Brázda, Jack Liao, Pavla Bažantová ... other authors
Year: 2019, Molecular Biology
journal article
 
p53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia
Robert Helma, Marek Petr, Matěj Adámik, Daniel Renciuk, Vlastimil Tichý, Alena Pastuchová, Zuzana Soldánová, Petr Pečinka, Richard Bowater, Miroslav Fojta, Marie Brázdová, Pavla BAŽANTOVÁ ... other authors
Year: 2019, Molecules
journal article
 
The Presence and Localization of G-Quadruplex Forming Sequences in the Domain of Bacteria
Martin Bartas, Michaela Čutová, Václav Brázda, Patrik Kaura, Jiří Šťastný, Jan Kolomazník, Jan Coufal, Pratik Goswami, Jiří Červeň, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2019, Molecules
journal article
 
Bioinformatics analyses and in vitro evidence for five and six stacked G-quadruplex forming sequences
Martin Bartas, Václav Brázda, Václav Karlický, Jiří Červeň, Petr Pečinka
Year: 2018, BIOCHIMIE
journal article
 
Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells
Martin Bartas, Jiří Červeň, Jan Oppelt, Matúš Peteja, Petr Vávra, Pavel Zonča, Václav Procházka, Václav Brázda, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2018, Oncology letters
journal article
 
Preferential binding of p53 and BRCA1 proteins to naturally occurring G-quadruplexes forming sequences
Jiří Červeň, Nikol Mikysková, Anna Niziolová, Martin Bartas, Václav Brázda, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2018
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Six-stacked G-quadruplexes as a preferential target of p53
Martin Bartas, Nikol Mikysková, Václav Brázda, Václav Karlický, Jiří Červeň, Vladimír Špunda, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2018
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
The Amino Acid Composition of Quadruplex Binding Proteins Reveals a Shared Motif and Predicts New Potential Quadruplex Interactors
Václav Brázda, Jiří Červeň, Martin Bartas, Nikol Mikysková, Jan Coufal, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2018, Molecules
journal article
 
Bioinformatic study of putative five and six stacked G-quadruplexes occurence in Homo sapiens genome
Martin Bartas, Václav Brázda, Jiří Červeň, Václav Karlický, Vladimír Špunda, Petr Pečinka ... other authors
Year: 2017
abstract in proceedings
 
Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera
Jiří Červeň, Zuzana Rybková, Hana Sezimová, Petr Pečinka, Kateřina Malachová
Year: 2016
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera
Zuzana Rybková, Kateřina Malachová, Jiří Červeň, Hana Sezimová, Petr Pečinka
Year: 2016, Journal of Biosciences and Medicines
journal article
 
Isolation of bacterial and fungal BPA and TBBPA degraders from polluted soils
Jiří Červeň, Zuzana Rybková, Hana Sezimová, Kateřina Malachová, Petr Pečinka, Rong Ji ... other authors
Year: 2016
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Electrochemical Activity of Wedelolactone and Probing its Interaction with DNA Using Voltammetry at a Carbon Electrode
Jiří Červeň, Luďěk Havran, Petr Pečinka, Miroslav Fojta
Year: 2015, ELECTROANAL
journal article
 
Impact of cadmium, cobalt and nickel on sequence-specific DNA binding of p63 and p73 in vitro and in cells
Matěj Adámik, Pavla Bažantová, Lucie Navrátilová, Alena Polášková, Petr Pečinka, Lucie Holanová, Vlastimil Tichý, Marie Brázdová ... other authors
Year: 2015, BIOCHEM BIOPH RES CO
journal article
 
Effect of transition metals on sequencespecific binding of p53 family proteins
Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Petr Pečinka, Matěj Adámik, Vlastimil Tichý, Marie Brázdová ... other authors
Year: 2014
abstract in proceedings
 
Electrochemical approach for detection of p53-DNA interactions
Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová
Year: 2014
abstract in proceedings
 
Kontaminace prostředí a změny na molekulárně genetické úrovni
Petr Pečinka, Jiří Červeň, Pavla Bažantová
Year: 2014, Ostravská univerzita v Ostravě
specialist book chapter
 
Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí
Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Aleš Dolný, Pavel Drozd, Zdeněk Ďuriš, Ivona Horká, Jiří Kalina, Václav Karlický, Petr Kočárek, Jana Kukutschová, Kateřina Malachová, Roman Maršálek, Zuzana Materová, Martin Mucha, Martin Navrátil, Zuzana Navrátilová, Jakub Nezval, Čeněk Novotný, Marie Opálková, Petr Pečinka, Vítězslav Plášek, Zuzana Rybková, Jan Semer, Hana Sezimová, Václav Slovák, Jan Ševčík, Vladimír Špunda, Jana Štefelová, Michal Štroch, Petra Veselá, Daniel Vrábl, Tomáš Zelenka ... other authors
Year: 2014, Ostravská univerzita v Ostravě
specialist book
 
Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí
Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Miroslav Fojta, Kateřina Malachová, Hana Sezimová ... other authors
Year: 2014
abstract in proceedings
 
EMSA detection of p53 sequence non-specific binding in PCR produced human DNA analogues
Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Barbora Chvátalová, Marie Brázdová
Year: 2013, J BIOMOL STRUCT DYN
journal article
 
Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells
Petr Pečinka, Marie Brázdová, Lucie Navrátilová, Vlastimil Tichý, Kateřina Němcová, Matěj Lexa, Roman Hrstka, Matěj Adámik, Bořivoj Vojtěšek, Emil Palaček, Wolfgang Deppert, Miroslav Fojta ... other authors
Year: 2013, PLOS one
journal article
 
Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo
Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Marie Brázdová
Year: 2012
abstract in proceedings
 
Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs
Petr Pečinka, Hana Pivoňková, P. Šebest, Olga Tichá, Kateřina Němcová, Marie Brázdová, Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Miroslav Fojta ... other authors
Year: 2010, BIOCHEM BIOPH RES CO
journal article
 
Detection of genotoxicity by the means of DNA repair enzymes
Petr Pečinka, Petr Kočárek, Zuzana Pavlíčková, Vítězslav Plášek, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Šárka Cimalová ... other authors
Year: 2008, University of Ostrava
specialist book chapter
 
DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.
Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Emil Paleček, Miroslav Fojta
Year: 2008, BIOCHEM J
journal article
 
Oxidative damage of DNA induced in plasmid by the reactions with chemical agents
Zuzana Pavlíčková, Petr Kočárek, Petr Pečinka, Vítězslav Plášek, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Šárka Cimalová ... other authors
Year: 2008, University of Ostrava
specialist book chapter
 
Detection of genotoxicity of environmental contaminants using bacterial mutagenicity tests and by means of plasmid DNA
Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA
Zuzana Pavlíčková, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA
Zuzana Pavlíčková, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007, Chemické zvesti
journal article
 
Inovace výběrových cvičení z mikrobiologie
Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007
research reports and final reports of opposed grants
 
Laboratorní cvičení z molekulární biologie
Petr Pečinka
Year: 2007
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
 
Obecná biologie
Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
 
Recognition of negatively or positively supercoiled DNA topoisomers by the p53 protein.
Hana Pivoňková, Olga Tichá, Miroslav Fojta, Petr Pečinka
Year: 2007, FEBS J
journal article
 
Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds
Jiří Červeň, Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
 
Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds
Jiří Červeň, Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2007, Chemické zvesti
journal article
 
Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě
Petr Pečinka, Kateřina Malachová, Zuzana Pavlíčková
Year: 2007
research reports and final reports of opposed grants
 
A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion.
Miroslav Fojta, Petra Brázdilová, Kateřina Cahová, Petr Pečinka
Year: 2006, ELECTROANALSIS
journal article
 
DNA modification with cisplatin affects sequence-specific DNA binding of p53 and p73 in the target site-dependent manner
Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Pavla Češková, Miroslav Fojta
Year: 2006, FEBS Journal
journal article
 
Nové trendy v biologických oborech
Kateřina Malachová, Petr Pečinka, Petr Kočárek, Zdeněk Majkus
Year: 2006
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
 
Optimalizace postupů elektrochemické detekce amplifikovaných úseků genomové DNA s využitím molekulární hybridizace
Miroslav Fojta, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Kateřina Cahová, Miloslava Fojtová
Year: 2006
abstract in proceedings
 
Ovlivnění interakce proteinů p53 a p73 s cílovými sekvencemi modifikací DNA cisplatinou
Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Pavla Češková, Miroslav Fojta
Year: 2006
abstract in proceedings
 
Sequence specific DNA binding of p53 can be enhanced by DNA supercoiling
Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2006
abstract in proceedings
 
Využití elektrochemických metod při analýze genové exprese
Miloslava Fojtová, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Kateřina Cahová, Luděk Havran, Miroslav Fojta ... other authors
Year: 2006
abstract in proceedings
 
Zkvalitnění a inovace výuky Cvičení z molekulární biologie
Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka
Year: 2006
research reports and final reports of opposed grants
 
Male infanticide in captive plains zebra (Equus burchelli).
Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors
Year: 2005, Animal Behaviour
journal article
 
Regulation of the DNA-binding ability of P53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies.
Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2005, FEBS J
journal article
 
Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling
Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Marie Brázdová ... other authors
Year: 2004, ONCOGENE
journal article
 
Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling.
Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Marie Brázdová ... other authors
Year: 2004, ONCOGENE
journal article
 
Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercolling
Eva Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček
Year: 2004
abstract in proceedings
 
Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry.
František Jelen, Alena Kouřilová, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2004, BIOELECTROCHEMISTRY
journal article
 
New ELISA technique for analysis of p53 protein/DNA binding properties
Eva Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Emil Paleček
Year: 2004
abstract in proceedings
 
Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies
Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2004
abstract in proceedings
 
Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by protein-kinase C, casein kinase II, cyclin dependent kinase and by monoclonal antibodies
Václav Brázda, Šárka Pospíšilová, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors
Year: 2004
abstract in proceedings
 
Aktivace vazby nádorového supresoru proteinu p53 k cílovým sekvencím superhelikální DNA
Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Analysis of p53 protein-DNA binding properties
Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Analysis of tumour suppressor p53 protein binding properties by new ELISA technique
Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Binding of tumor suppressor protein p53 to supercoiled and chemically modified DNA
Miroslav Fojta, Václav Brázda, Hana Pivoňková, Marie Brázdová, Petr Pečinka, Emil Paleček, Jan Paleček ... other authors
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry
František Jelen, René Kizek, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Rozpoznání struktury DNA nádorově supresorovým proteinem p53. Úloha jeho C-terminální domény
Miroslav Fojta, Hana Pivoňková, Marie Brázdová, Petr Pečinka, Václav Brázda, Emil Paleček ... other authors
Year: 2003
abstract in proceedings
 
Analysis of p53 protein-DNA binding properties by new ELISA technique, activation of p53-DNA binding
Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors
Year: 2002
abstract in proceedings
 
Regulation of p53 binding to natural binding elements in supercoiled DNAs by monoclonal antibodies
Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 2002
abstract in proceedings
 
Role of tumor suppressor p53 domains in supercoil-selective binding to DNA and p53-DNA filament formation
Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček, Miroslav Fojta ... other authors
Year: 2002
abstract in proceedings
 
Role of tumor suppressor p53domains in selective binding to supercoiled DNA.
Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Miroslav Fojta, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček ... other authors
Year: 2002, Nucleic Acids Research
journal article
 
Role proteinových domén nádorového supresoru p53 při selektivní vazbě na superhelikální DNA a při tvorbě DNA-proteinových filament
Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček, Miroslav Fojta ... other authors
Year: 2002
abstract in proceedings
 
Effects of Oxidation Agents and Metal Ions on Binding of p53 to Supercoiled DNA.
Miroslav Fojta, Marie Brázdová, Hana Černocká, Petr Pečinka, Václav Brázda, Jan Paleček, Eva Jagelská, Bořivoj Vojtěšek, Šárka Pospíšilová, V. Subramaniam, Thomas M. Jovin, Emil Paleček ... other authors
Year: 2000, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
journal article
 
DNA tetraplex formation in the control region of c-myc.
Tomas Simonsson, Petr Pečinka, Mikael Kubista
Year: 1998, Nucleic Acids Research
journal article
 
studijní pobyt
Petr Pečinka
Year: 1996
work experience abroad
 
. Chemical and electrochemical probing of local DNA structures and the role of DNA structures in cancer and genetic diseases
Emil Paleček, Miroslav Fojta, František Jelen, Petr Pečinka
Year: 1995, Physics, Chem. and applications of molecular systems Brno
journal article
 
Chemical Probing of DNA Structure in Cells: Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine.
Emil Paleček, Petr Pečinka
Year: 1995
abstract in proceedings
 
Intramolecular TAT triplex in (dA)58.(dT)58. Influence of ions.
Petr Pečinka, Dori Huertas, Fernando Azorin, Emil Paleček
Year: 1995, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics
journal article
 
Probing of DNA structure with osmium tetroxide complexes.
Emil Paleček, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková, Jana Řičicová, Pavla Boublíková
Year: 1993, Collection Czech. Chem. Commun.
journal article
 
Osmium tetroxide complexes: single-strand selective probes of the DNA structure in vitro and in cells.
Emil Paleček, František Jelen, Karel Nejedlý, Jan Paleček, Petr Pečinka, Jana Řičicová, Marie Vojtíšková, Dagmar Zachová ... other authors
Year: 1992, Birghauser Verlag
specialist book chapter
 
výzkumný pobyt
Petr Pečinka
Year: 1992
work experience abroad
 
Osmium tetroxide reactivity of DNA bases in nucleotide sequencing and probing of DNA structure.
František Jelen, Petr Karlovský, Eva Makaturová, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year: 1991, General Physiology and Biophysics
journal article
 
Chemical proabing of the DNA polymorphic structure in vitro and in situ.
Emil Paleček, Pavla Boublíková, František Jelen, Alena Krejčová, Eva Makaturová, Karel Nejedlý, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková ... other authors
Year: 1990, Adenine Press
specialist book chapter
 
Protonated triplex DNA in E. coli cells as detected by chemical probing.
Petr Karlovský, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková, Eva Makaturová, Emil Paleček
Year: 1990, FEBS Letters
journal article
 
Metallotropic forms of zinc, copper and cadmium carbonic-anhydrases and zinc carboxypeptidase reflected in differential pulse polarography.
Marie Studničková, Jana Pitřincová, Jan Kovář, Petr Pečinka, Jaroslav Turánek, Oldřich Fischer ... other authors
Year: 1989, Bioelectrochemistry and Bioenergetics
journal article
 
Binding of p53 protein to supercoiled DNA
Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Marie Brázdová, Jan Paleček, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Miroslav Fojta ... other authors
Year:
abstract in proceedings
 
Improved procedures for electrochemical detection of DNA hybridization with PCR-amplified target DNA?s
Miroslav Fojta, Kateřina Cahová, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Miloslava Fojtová, Luděk Havran ... other authors
Year:
abstract in proceedings
 
Influence of cisplatin DNA modification on sequence-specific internations of p53 and p73 with different consensus sequence.
Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Miroslav Fojta
Year:
abstract in proceedings
 
Interakce proteinu p53 s DNA: Sekvenčně specifická vazba a rozpoznání konformace DNA
Miroslav Fojta, Hana Pivoňková, Kateřina Němcová, P. Šebest, Petr Pečinka, Eva Brázdová-Jagelská, Marie Brázdová, Václav Brázda, Emil Paleček ... other authors
Year:
abstract in proceedings
 
Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies
Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček
Year:
abstract in proceedings
 
Stripping voltammetry of oligonucleotides
František Jelen, Alena Kouřilová, Petr Pečinka, René Kizek, Libuše Trnková, Emil Paleček ... other authors
Year:
abstract in proceedings
 

No record found.

View more records

View more records

View more records

View more records

View more records

View more records

View more records

View more records



Abbreviation
Subject
CZBI1
Biologie I
BIOIN
Praktický kurz bioinformatiky
BI1LF
Biologie I.
BI2LF
Biologie II.
DPROT
Proteomika
GENZS
Obecná biologie
MEMOB
Vybrané metody molekulární biologie
MEMOL
Vybrané metody molekulární biologie
MOBIC
Molekulární biologie (praktika)
MOBIP
Molekulární biologie (přednáška)
MOBIS
Molekulární biologie
MOBIU
Molekulární biologie
MOLBI
Molekulární biologie
MOLBS
Molekulární biologie
MOLGE
Základy molekulární biologie a genetiky
OBEBC
Molekulární biologie a genetika - cv.
OBEBI
Obecná biologie
OBEBP
Molekulární biologie a genetika - př.
POMBI
Pokročilé metody v molekulární biologii
PRS01
Specializační seminář 1
PRS02
Specializační seminář 2
PRS03
Specializační seminář 3
PRS04
Specializační seminář 4
PRS05
Specializační seminář 5
PRS06
Specializační seminář 6
PRS07
Specializační seminář 7
PRS08
Specializační seminář 8
PRS09
Specializační seminář 9
PRS10
Specializační seminář 10
PRS11
Specializační seminář 11
PRS12
Specializační seminář 12
QCII1
Článek v index. imp. časopise 1
QCII2
Článek v index. imp. časopise 2
QCII3
Článek v index. imp. časopise 3
QCIN1
Článek v index. neimp. časopise 1
QCIN2
Článek v index. neimp. časopise 2
QCIN3
Článek v index. neimp. časopise 3
QELME
Elektromigrační metody
QMOSY
Molekulární systematika
QMVK1
Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 1
QMVK2
Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 2
QMVK3
Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 3
QNVK1
Akt. účast na národní vědecké konf. 1
QNVK2
Akt. účast na národní vědecké konf. 2
QNVK3
Akt. účast na národní vědecké konf. 3
QSTNK
Struktura nukleových kyselin
QTOGE
Toxikologie a genotoxikologie
QVYC1
Výuková činnost 1
QVYC2
Výuková činnost 2
QZMVP
Zapojení do mezinárodního výzk. projektu
QZNVP
Zapojení do národního výzk. projektu
QZPD2
Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPD
Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPK
Zahraniční studijní pobyt krátkodobý
QZSPS
Zahraniční studijní pobyt střednědobý
STRNK
Struktura a funkce nukleových kyselin
SZMBB
Část SZZ: Molekulární Bi a biochemie
VMMOB
Vybrané metody molekulární biologie
WBINF
Bioinformatics
WPMMB
Advanced course of molecular biology
WVMMB
Selected methods of molecular biology
XGENZ
Základy molekulární biologie a genetiky
YAPEB
Aktuální přístupy v experimentální biolo
YMOBI
Molekulární biologie
YOBBI
Obecná biologie
ZGENI
Základy genového inženýrství
0IBIO
Biologie
6MBL2
Molecular Biology Laboratory II
6MOBU
Molekulární a buněčná biologie
7BAPR
Bakalářská práce
7DIPR
Diplomová práce
7MOBC
Molekulární biologie (cvičení)
7MOBM
Molekulární biologie (cvičení malé)
7MOBP
Molekulární biologie (přednáška)
7MOBU
Molekulární a buněčná biologie
7MOBV
Molekulární biologie (cvičení velké)
7PBP2
Příprava bakalářské práce 2
7PDP1
Příprava diplomové práce 1
7PDP2
Příprava diplomové práce 2
7PMMB
Pokročilé metody v molekulární biologii
7SDP1
Seminář k diplomové práci 1
7SDP2
Seminář k diplomové práci 2
7SEM1
Specializovaný diplomový seminář 1
7SEM2
Specializovaný diplomový seminář 2
7SEM3
Specializovaný diplomový seminář 3
7SFNK
Struktura a funkce NK
7VMMB
Vybrané metody molekulární biologie
7ZAGI
Základy genového inženýrství
8ELME
Elektromigrační metody
8SFNK
Struktura a funkce nukleových kyselin
9BIO1
Biologie I
8PROT
Proteomika
9PROT
Proteomics
DEMME
Elektromigrační metody
BI2LF
Biologie II.
YBI2L
Biology II.
9BI2L
Biologie II.



Author
Title
Type of thesis
Year
Bartas Martin
Bioinformatic analyses of Non-B DNA structures and interacting proteins
Doctoral thesis
2020
Bažantová Pavla
Interactions of p53 protein family with non-B DNA structures
Doctoral thesis
2018
Poláčková Petra
Study of the c-myc gene structure in linear and supercoiled DNA
Master's thesis
Marzoll Jiří
Structural bioinformatics of G-quadruplex binding proteins and their interactions with noncanonical nucleic acids structures
Master's thesis
2023
Guziurová Simona
Bioinformatic analysis of proteins interacting with DNA triplexes
Master's thesis
2021
Slychko Kristyna
Bioinformatic analysis of proteins interacting with Z-DNA
Master's thesis
2021
Quasnitza Marie
Interaction of tumor suppressor proteins with selected promotor sequences
Master's thesis
2020
Matějová Aneta
The optimalization of new high troughput method for the screening of potential G-quadruplex DNA sequences
Master's thesis
2019
Niziolová Anna
Thermostability of BRCA1-DNA complexes.
Master's thesis
2019
Vanduchová Veronika
In vitro characterization of selected human potential G-quadruplex loci
Master's thesis
2019
Kwaśný Ondřej
Binding of BRCA1 protein on local DNA structures.
Master's thesis
2018
Mikysková Nikol
Thermostability of p53-DNA complexes.
Master's thesis
2018
Kuchárová Zuzana
The study of protein BRCA1-DNA interactions.
Master's thesis
2017
Schillerová Sarah
The study of mutant p53 proteins interactions with DNA.
Master's thesis
2017
Wielgusová Kateřina
Influence of ions on the protein BRCA1-DNA interactions.
Master's thesis
2017
Brož David
The isolation and characterization of proteins involving in apoptosis.
Master's thesis
2016
Kopečková Monika
Making of recombinant plasmids for the study of DNA-protein interactions in vivo.
Master's thesis
2015
Podešvová Lucie
Making use of crosslinking for the analysis of DNA-protein interactions.
Master's thesis
2015
Tulingerová Zuzana
Interaction of p73 protein with linear and supercoiled DNA.
Master's thesis
2015
Wozniaková Lucie
The influence of local structure DNA forming sequences on the replication of DNA plasmids.
Master's thesis
2015
Žihala David
Study of the DNA-protein interactions by means of footprinting
Master's thesis
2015
Chvátalová Barbora
The influence of naturally occuring sequence DNA on the interaction w?th p53 protein.
Master's thesis
2014
Drozdková Denisa
Gel electrophoresis as a tool for the detection of 3´- DNA ends prolonged by terminal deoxynucleotidyl transferase.
Master's thesis
2014
Bažantová Pavla
Interaction of p63 protein with p53CON in linear and supercoiled DNA.
Master's thesis
2012
Hodslavská Veronika
Mutation analysis of LDL receptor gene (LDLR) in familial hypercholesterolemia patients
Master's thesis
2012
Klemensová Eva
Detection of DNA damage by means of piperidine cleavage, reparation enzymes and/or PCR.
Master's thesis
2012
Kovácsová Andrea
Binding of tumor suppressor p53 to tetraplex DNA.
Master's thesis
2012
Moudrá Eva
Detection of DNA-damage caused by industrial dyes.
Master's thesis
2012
Podzimková Veronika
The study of apoptotic structural changes in DNA by means of gel electrophoresis.
Master's thesis
2012
Semer Jan
Using of PCR for the detection of dsDNA damage by osmium tetroxide complexes and diethylpyrocarbonate.
Master's thesis
2012
Boháčová Petra
Influence of genotoxic and mutagenic agents on the topological state of plasmid DNA
Master's thesis
2011
Hermanová Monika
Detection of local open strtuctures in natural p53-binding sequences by means of structural probes.
Master's thesis
2011
Široká Jana
Electrochemical detection of single-stranded tracts synthetized by means of terminal transferase in circle and linear DNA molecules.
Master's thesis
2011
Maršálková Karla
Sequence-specific binding of protein p53. Influence of ions
Master's thesis
2010
Dočkalová Zuzana
Study on genetic erosion risks during conservation process of genetic
Master's thesis
2009
Červeň Jiří
DETECTION OF MUTAGENICITY AND GENOTOXICITY BY MEANS OF CHANGES IN PLASMID DNA TOPOLOGY
Master's thesis
2008
Antošíková Markéta
DNA Topoisomerases: Structure, Functions, and their Therapeutic potential
Bachelor's thesis
2023
Valčičáková Kateřina
microRNAs as indicators of human diseases
Bachelor's thesis
2023
Warmuzová Maxima
G-quadruplex binding proteins in plants
Bachelor's thesis
2022
Papikova Adela
Methods for studying precise localisation of protein: non-B-DNA structures interactions
Bachelor's thesis
2021
Bajtková Sabina
Chemicals stabilizing G-quaduplexes
Bachelor's thesis
2020
Bartošková Alena
Proteins interacting with left-handed Z-DNA.
Bachelor's thesis
2020
Marzoll Jiří
Proteins interacting with DNA G-quadruplexes
Bachelor's thesis
2020
Guziurová Simona
Proteins interacting wih DNA triplexes
Bachelor's thesis
2019
Palej Filip Roderik
DNA sequencing techniques
Bachelor's thesis
2019
Sluková Zdeňka
Mechanism of double-stranded breaks repair.
Bachelor's thesis
2018
Matějová Aneta
Influence of c-myc protein on the tumor formation.
Bachelor's thesis
2017
Vanduchová Veronika
Influence of pAPC protein on the tumor formation.
Bachelor's thesis
2017
Niziolová Anna
Binding of BRCA1 to damaged DNA. Interactions with proteins.
Bachelor's thesis
2016
Skýbová Tereza
Formation of epigenetics patterns during development of Drosophyla melanogaster.
Bachelor's thesis
2016
Ručková Romana
Detection of local structure DNA in vitro and in vivo.
Bachelor's thesis
2015
Wielgusová Kateřina
Influence of the tumour suppressor BRCA1 to repairing damaged DNA.
Bachelor's thesis
2015
Beinhauerová Martina
Structure and function of the tumour suppressor BRCA1.
Bachelor's thesis
2014
Beinhauerová Monika
Interaction of proteins of the 14-3-3 family with DNA.
Bachelor's thesis
2014
Kuchárová Zuzana
Structural changes in the regulation regions of protooncogenes and tumour suppressors.
Bachelor's thesis
2014
Kwaśný Ondřej
Interaction of IFI16 protein with DNAs and proteins.
Bachelor's thesis
2014
Schillerová Sarah
The influence of mutations in p53 gene on the tumour formation: changes in the binding preferences, the hot spots.
Bachelor's thesis
2014
Brož David
Analysis of interactions of p53 protein with sequences not containing p53CON.
Bachelor's thesis
2013
Kopečková Monika
Interactions of p53 protein with linear and supercoiled DNA not containing p53CON.
Bachelor's thesis
2013
Kortišová Lucie
Industrial dyes and their interaction with DNA.
Bachelor's thesis
2013
Podešvová Lucie
Structural analysis of naturally occuring DNA sequences interacting with tumor suppressor p53.
Bachelor's thesis
2013
Wozniaková Lucie
Influence of agents used in Ames test.on the topological state of plasmid DNA.
Bachelor's thesis
2013
Žihala David
Chromatine immunoprecipitation as a tool of the research of the interactions p53 with DNA.
Bachelor's thesis
2013
Bahounková Hana
Immunochemical methods used in the research of tumour suppressor p53.
Bachelor's thesis
2012
Chvátalová Barbora
Structural analysis of p53-binding sequence in supercoiled and linear DNA.
Bachelor's thesis
2012
Feber Kamil
Potential of usage of double-surface electrochemical methods in nucleic acids analysis.
Bachelor's thesis
2012
Holubová Aneta
Sequence-nonspecific interactions of protein p53 with DNA.
Bachelor's thesis
2012
Janečková Ema
Sequences forming G4-structures - properties, occurrence, their role in the gene expression.
Bachelor's thesis
2012
Stočesová Adéla
Detection of structural changes in the c-myc promotor by structural probes and polymerace chain reaction.
Bachelor's thesis
2011
Zbránková Veronika
Structure of homopurine.homopyrimidine sequences and their role at formation of genetic diseases.
Bachelor's thesis
2011
Bažantová Pavla
Binding of p63 protein to sequence-specific p53 (p53CON) binding sites.
Bachelor's thesis
2010
Ondráček Tomáš
Detection of DNA-cleavage by means of a piperidine and the polymerase chain reaction.
Bachelor's thesis
2010
Semer Jan
PCR optimization for the detection of DNA damage by means of osmium tetroxide complexes and diethylpyrocarbonate.
Bachelor's thesis
2010
Boháčová Petra
The comparison of genotoxic compounds behaviour in bacteria (in situ) and in vitro.
Bachelor's thesis
2009
Hermanová Monika
Structural characterization of naturally occurring binding sequences of p53 tumour suppressor
Bachelor's thesis
2009
Klemensová Eva
Detection of DNA damage by means of the polymerase chain reaction.
Bachelor's thesis
2009
Mičková Pavlína
Detection of mutagenic and potencial genotoxic chemicals by means of changes in plasmid DNA topology
Bachelor's thesis
2009
Moudrá Eva
Detection mutagenous and potential genotoxic compounds by repair enzymes
Bachelor's thesis
2009
Široká Jana
Detection of DNA damage by means of electrochemical methods.
Bachelor's thesis
2009
Urbanová Šárka
The preparation of recombinant plasmids containing p53CON binding sites. Characterization of p53-plasmid DNAs interactions.
Bachelor's thesis
2009
Kovácsová Andrea
The alkylation of DNA and methods of DNA-damage detection
Bachelor's thesis
2008
Maršálková Karla
Binding of a tumor suppressor p53 on open local structures in a superhelical DNA
Bachelor's thesis
2008
Šafarčíková Lucie
Sequence-specific and sequence-nonspecific binding of tumor suppressor p53 on scDNA
Bachelor's thesis
2008
Zumrová Kateřina
Utilization of electro-chemical methods for DNA-damage detection
Bachelor's thesis
2008
Dočkalová Zuzana
Research of genetic stability of selected pea (Pisum sativum L.) genotypes
Bachelor's thesis
2007
Dohnalová Táňa
Inactivation of FAD2 desaturase gene in flax (Linum usitatissimum L.) through the use of transgenic technology RNA interference
Bachelor's thesis
2007



Monitoring the spread of antibiotic-resistant bacteria and genes in the wastewater and recipient, the study of non-canonical forms of nucleic acids, investigation of molecular changes in Papaver somniferum exposed to stress conditions
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2022 - 12/2022
Provider
Specifický VŠ výzkum
State
finished
 
Utilization of genomic and transcriptomic approaches to create genetic resources and breeding materials of poppy with specific traits
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2018 - 12/2022
Provider
Ministerstvo zemědělství
State
solved
 
Isolation and characterization of DNA-binding properties of BRCA1 protein.
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2016 - 12/2016
Provider
Specifický VŠ výzkum
State
finished
 
Structure and sequence specific DNA interactions of p53 protein family.
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2015 - 12/2015
Provider
Specifický VŠ výzkum
State
finished
 
Vliv iontů těžkých kovů na vazebné schopnosti proteinů rodiny p53
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2015 - 12/2015
Provider
Katedra biologie a ekologie, Projekty podporované z rozpočtu měst krajských úřadů
State
finished
 
Development of modern trends in experimental biology: importance of biomolecular interactions for functions of cellular structures
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
4/2012 - 3/2015
Provider
OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
State
finished
 
Characterization of binding properties of p53 protein family to structure and sequence specific DNA.
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2014 - 12/2014
Provider
Specifický VŠ výzkum
State
finished
 
Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2010 - 12/2012
Provider
OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
State
finished
 
Tvorba předmětu "Pokročilé metody v molekulární biologii" pro studenty navazujícího studia Experimentální biologie
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2011 - 12/2011
Provider
Fond rozvoje vysokých škol
State
finished
 
Interactions of wild type and mutant p53 proteins with damaged DNA and their roles in cellular response to anticancer chemotherapy
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2007 - 12/2010
Provider
Standardní grantový projekt GA AV
State
finished
 
PřF 1074
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
9/2006 - 12/2009
Provider
Děkanát PřF
State
finished
 
Zkvalitnění laboratorních cvičení předmětu Vybrané metody molekulární biologie a zavedení nových praktických úloh
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2009 - 12/2009
Provider
Fond rozvoje vysokých škol
State
finished
 
Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě
Main solver
doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period
1/2007 - 12/2007
Provider
Fond rozvoje vysokých škol
State
finished
 

rss
social hub